索引

B

base() （mlqtl.data.plink.Plink 方法）

base() （mlqtl.data.snp.Plink 方法）

C

cal_padj()（在 mlqtl.datautils 模块中） cal_sliding_window()（在 mlqtl.datautils 模块中） check_chrom() （mlqtl.data.dataset.Dataset 方法）

chrom（mlqtl.data.gene.Gene 属性） chrom（mlqtl.data.snp.SNP 属性） chunks() （mlqtl.data.gene.Gene 方法） convert_onehot()（mlqtl.data.snp.SNP 静态方法）

D

Dataset（mlqtl.data.dataset 中的类）

duplicated_markers（mlqtl.data.plink.Plink 属性） duplicated_markers（mlqtl.data.snp.Plink 属性）

E

encode() （mlqtl.data.snp.SNP 方法）

F

feature_importance()（在 mlqtl.train 模块中） filter() （mlqtl.data.gene.Gene 方法）

filter_by_chr() （mlqtl.data.gene.Gene 方法） filter_df() （mlqtl.data.trait.Trait 方法）

G

Gene（mlqtl.data.gene 中的类） get() （mlqtl.data.dataset.Dataset 方法） get() （mlqtl.data.gene.Gene 方法） get() （mlqtl.data.snp.SNP 方法）

get() （mlqtl.data.trait.Trait 方法） get_class_from_path()（在 mlqtl.utils 模块中） get_hap() （mlqtl.data.dataset.Dataset 方法） gff3_to_range()（在 mlqtl.utils 模块中） gtf_to_range()（在 mlqtl.utils 模块中）

I

idx2marker() （mlqtl.data.plink.Plink 方法）

idx2marker() （mlqtl.data.snp.Plink 方法） init_worker()（在 mlqtl.train 模块中）

M

marker2idx() （mlqtl.data.plink.Plink 方法） marker2idx() （mlqtl.data.snp.Plink 方法） MatrixFloat64()（在 mlqtl.nda_typing 模块中） MatrixInt8()（在 mlqtl.nda_typing 模块中） merge_window()（在 mlqtl.datautils 模块中） MLMetrics（mlqtl.train 中的类） mlqtl module mlqtl.cli module mlqtl.data module mlqtl.data.dataset module mlqtl.data.gene module mlqtl.data.plink module mlqtl.data.snp module mlqtl.data.trait module mlqtl.datautils module

mlqtl.nda_typing module mlqtl.plot module mlqtl.train module mlqtl.utils module module mlqtl mlqtl.cli mlqtl.data mlqtl.data.dataset mlqtl.data.gene mlqtl.data.plink mlqtl.data.snp mlqtl.data.trait mlqtl.datautils mlqtl.nda_typing mlqtl.plot mlqtl.train mlqtl.utils

N

nb_markers（mlqtl.data.plink.Plink 属性） nb_markers（mlqtl.data.snp.Plink 属性） nb_samples（mlqtl.data.plink.Plink 属性）

nb_samples（mlqtl.data.snp.Plink 属性） next() （mlqtl.data.plink.Plink 方法） next() （mlqtl.data.snp.Plink 方法）

P

Plink（mlqtl.data.plink 中的类） Plink（mlqtl.data.snp 中的类）

plot_feature_importance()（在 mlqtl.plot 模块中） plot_graph()（在 mlqtl.plot 模块中） proc_train_res()（在 mlqtl.datautils 模块中）

R

run_plink()（在 mlqtl.utils 模块中）

S

samples（mlqtl.data.snp.SNP 属性） significance()（在 mlqtl.datautils 模块中）

skip_padj()（在 mlqtl.datautils 模块中） sliding_window()（在 mlqtl.datautils 模块中） SNP（mlqtl.data.snp 中的类）

T

TensorFloat64()（在 mlqtl.nda_typing 模块中） train()（在 mlqtl.train 模块中） train_batch()（在 mlqtl.train 模块中）

train_single()（在 mlqtl.train 模块中） train_with_progressbar()（在 mlqtl.train 模块中） Trait（mlqtl.data.trait 中的类）

U

update() （mlqtl.train.MLMetrics 方法）

V

VectorBool()（在 mlqtl.nda_typing 模块中） VectorFloat64()（在 mlqtl.nda_typing 模块中）

VectorInt8()（在 mlqtl.nda_typing 模块中） VectorStr()（在 mlqtl.nda_typing 模块中）